生物学论文_基于生物信息学分析CILP2基因在结
文章摘要:目的:探究CILP2基因在结直肠癌中的表达,分析CILP2基因的表达与临床病理特征、预后的关系,探索CILP2基因在结直肠癌发生发展中的作用机制。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库官方网站上下载结直肠癌的RNA-seq数据及患者的临床病理信息,提取CILP2在结直肠癌组织和正常组织样本中的表达量数据,使用Mann-Whitney U检验分析两组之间的表达差异。根据CILP2在结直肠癌样本中表达水平的中位数,将结直肠癌患者划分为高、低表达两组,使用χ2检验分析CILP2表达与患者临床病理特征的联系,利用Kaplan-Meier法分析CILP2表达与患者预后的相关性。使用单因素和多因素Cox回归分析CILP2表达与结直肠癌患者临床预后相关性。利用基因富集分析(GSEA)探索CILP2在结直肠癌中参与的信号途径。结果:结直肠癌样本中CILP2表达水平显著高于正常组织中CILP2的表达水平,差异具有统计学意义(P<0.05);CILP2的表达与患者的原发肿瘤分期(P=0.014)和淋巴结转移分期(P=0.016)显著相关。CILP2高表达组患者的总体生存率显著低于低表达组患者,且差异具有统计学意义(P=0.009)。多因素Cox回归分析显示,CILP2可以作为结直肠癌患者的独立预后因素(HR=1.288,95%CI:1.058~1.569,P=0.012)。GSEA富集分析结果提示,CILP2主要参与WNT信号通路、刺猬信号通路、肿瘤相关的通路等通路。结论:CILP2在结直肠癌中表达上调,参与多种癌症信号通路,可作为结直肠癌患者的独立预后因素,是结直肠癌新型分子标志物。
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项目基金:文章来源:《世界临床药物》 网址: http://www.sjlcywzz.cn/qikandaodu/2022/0108/1879.html